Workshop avec Jean-Baptiste Poline « Harmonizing, standardizing, and sharing data: challenges and practices »


Quand ? 13 décembre 2024, 9:00 – 13:00
Où ? Campus de Saint Charles, bâtiment 9, salle Phy51
Pourquoi ? Jean-Baptiste développe depuis près de 30 ans des méthodes biostatistiques pour le traitement et l’analyse de données neuroscientifiques. Il est un fervent défenseur et un pionnier du partage des données, ayant contribué au développement de plusieurs outils dans ce domaine pour l’IRMf et d’autres (par exemple, le format BIDS ou plus récemment neurobagel et nipoppy*). Il partagera ses idées et son expérience sur les aspects conceptuels et pratiques de la gestion des bases de données neuroscientifiques à différentes échelles.
Comment ?
Nous prévoyons de structurer l’atelier en trois parties :

  • Une introduction interactive pour présenter les intérêts, les défis, les contraintes, les barrières et les opportunités du partage de données
  • Une démonstration à l’aide d’un jeu de données réel
  • Une session plus pratique pour ceux qui veulent rester et acquérir une expérience pratique en utilisant leur propre ensemble de données sur leur propre ordinateur

Qui devrait y assister ? Toute personne souhaitant en savoir plus ou discuter de la structuration et de l’utilisation des bases de données, ainsi qu’acquérir une expérience pratique avec divers outils.

Pour nous aider à mieux nous organiser, veuillez vous inscrire en utilisant le lien suivant si vous prévoyez d’être présent (et avec quel niveau de certitude) : https://columbo.univ-amu.fr/index.php/687427?lang=fr

*Notes:

  • nipoppy est une extension de BIDS pour organiser vos données et les traiter localement
  • neurobagel vous permet de découvrir ou de partager des données entre laboratoires/institutions et de créer des cohortes (déjà adopté par OpenNeuro). À l’avenir, il permettra des analyses distribuées, ce qui est important en raison des réglementations RGPD