- Workshop avec Jean-Baptiste Poline « Harmonizing, standardizing, and sharing data: challenges and practices »
Quand ? 13 décembre 2024, 9:00 – 13:00
Où ? Campus de Saint Charles, bâtiment 9, salle Phy51
Pourquoi ? Jean-Baptiste développe depuis près de 30 ans des méthodes biostatistiques pour le traitement et l’analyse de données neuroscientifiques. Il est un fervent défenseur et un pionnier du partage des données, ayant contribué au développement de plusieurs outils dans ce domaine pour l’IRMf et d’autres (par exemple, le format BIDS ou plus récemment neurobagel et nipoppy*). Il partagera ses idées et son expérience sur les aspects conceptuels et pratiques de la gestion des bases de données neuroscientifiques à différentes échelles.
Comment ? Nous prévoyons de structurer l’atelier en trois parties :- Une introduction interactive pour présenter les intérêts, les défis, les contraintes, les barrières et les opportunités du partage de données
- Une démonstration à l’aide d’un jeu de données réel
- Une session plus pratique pour ceux qui veulent rester et acquérir une expérience pratique en utilisant leur propre ensemble de données sur leur propre ordinateur
Qui devrait y assister ? Toute personne souhaitant en savoir plus ou discuter de la structuration et de l’utilisation des bases de données, ainsi qu’acquérir une expérience pratique avec divers outils.
Pour nous aider à mieux nous organiser, veuillez vous inscrire en utilisant le lien suivant si vous prévoyez d’être présent (et avec quel niveau de certitude) : https://columbo.univ-amu.fr/index.php/687427?lang=fr
*Notes:
- nipoppy est une extension de BIDS pour organiser vos données et les traiter localement
- neurobagel vous permet de découvrir ou de partager des données entre laboratoires/institutions et de créer des cohortes (déjà adopté par OpenNeuro). À l’avenir, il permettra des analyses distribuées, ce qui est important en raison des réglementations RGPD
- Stimulation auditive & anti-bruit actif en IRM / IRMf
Voici la version PDF de la présentation de Bruno Nazarian au séminaire du CRMBM du 7 février 2022.
Le thème principal de cette présentation est l’anti-bruit actif, mais présente plus largement les différentes techniques, technologies et outils de stimulation auditive en IRM.
Cliquez ici pour la présentation au format PDF
- Electro-Myographie dans l’IRM : Présentation technique et pédagogique
L’acquisition (et l’utilisation) de signaux électro-myographiques (EMG) en IRM Fonctionnelle pose de nombreux problèmes techniques et méthodologiques
Le Centre IRM a développé un ensemble d’outils matériels et logiciels permettant d’appréhender cette question
La présentation introduit les aspects physiques liés aux sources de bruits d’induction puis les outils d’acquisition et de traitement permettant de s’en affranchir. Enfin, quelques résultats sont illustrés.
Ce travail a été présenté lors de la RMN du 21 décembre 2021
Télécharger la présentation au format PDF
- « Technical Lectures » : l’IRM pour les Neurosciences
L’INT et le centre IRM organisent deux sessions exceptionnelles de « Technical Lectures » autour de l’IRM :
vendredi 11 et vendredi 18 décembre (13h30 – 15h30).L’objectif de ces sessions est de présenter de façon simple et didactique les nombreuses possibilités offertes par l’IRM pour les recherches en Neurosciences. Exceptionnellement, les diapositives sont présentées en anglais et le discours en français.
Ces séminaires pédagogiques s’adressent à toutes et tous, et en particulier aux étudiants et aux chercheurs non spécialistes de l’IRM. Ils sont l’occasion de poser des questions et de mieux comprendre les techniques IRM de pointe utilisées en neurosciences, dont beaucoup sont développées au sein de l’INT.– Vendredi 11/12/2020 (13h30 – 15h30) : Part 1 : Magnetic Resonant (MR) Imaging of cerebral structure (voir le pdf 35 Mo)
– Vendredi 18/12/2020 (13h30 – 15h30) : Part 2 : Functional MR Imaging : brain activity and functional connectivity (voir le pdf 26 Mo)Les intervenants sont des ingénieurs et chercheurs de l’INT et du Centre IRM-INT : Jean-Luc Anton, Guillaume Auzias, Pascal Belin, Thierry Chaminade, Olivier Coulon, Julien Lefèvre, Kep Kee Loh, David Meunier, Bruno Nazarian, Julien Sein, Sylvain Takerkart.
Pour celles et ceux d’entre vous qui ne faites pas partie de l’INT, merci de contacter <intanimascience@gmail.com> et/ou <Jean-Luc.Anton@univ-amu.fr> afin de recevoir le lien de connexion à la visio-conférence (lien identique pour les deux sessions).